A missão da SBSP é promover a pesquisa e o ensino da Botânica como ciência que se dedica ao estudo da forma, da função, do desenvolvimento, da diversidade, da reprodução, da evolução e do uso econômico das plantas, bem como suas interações na biosfera terrestre.
Para cumprir essa missão, a SBSP tem por objetivos: (1) Mostrar a importância das plantas para o homem, passando por aspectos relacionados à sua classificação, anatomia, ecologia e meio ambiente, fisiologia, paisagismo e usos industriais e comerciais; (2) Promover a pesquisa e o ensino da Botânica em seus diferentes níveis; (3) Divulgar por meio de cursos e eventos os avanços no conhecimento nas diferentes áreas da Botânica; (4) Promover a realização de eventos científicos que visem a reunir e integrar os profissionais e estudantes da área de Botânica de todo o país para a divulgação de seus resultados de pesquisa, bem como oferecer a oportunidade para a discussão de temas atuais e o estabelecimento de colaborações entre pesquisadores e instituições.
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